与纯粹的固态磁盘阵列相比，将SSD用于分层储存，或是以Flash存储器作为储存设备的第2层快取，两种做法都是属于混合应用传统硬盘与NANDFlash闪存的架构，也同样是将Flash闪存置于速度较慢的传统硬盘与高速的DRAMCache之间，但由于存取方式上存在许多差异，从而产生不同的特性：
　　
　　在数据存取中的角色不同
　　
　　如名称所示，Flash记忆体在分层储存中扮演硬盘角色，在第2层快取应用中则扮演高速缓冲存储器角色。
　　
　　分层储存中的SSD是作为一个永久存放数据的储存装置，透过分层技术，数据是被“迁移”到SSD中，除了存取速度较快外，SSD中的数据在逻辑上与传统硬盘是一样的；而当以Flash记忆体作为第2层快取时，Flash记忆体则是充当存取数据的缓冲区，数据是从底层磁盘区中“复制一份”到高速缓冲存储器中（注意是复制而非迁移），读入Flash快取中的数据只是暂存，而不是永久性保存。
　　
　　运作机制差异
　　
　　在自动化分层储存架构中，自动化分层储存技术会先按照预设政策将数据写入各层级磁盘，并以Volume、LUN或一定的区块大小为单位，持续或定期追踪记录数据的存取频率（或者说是活跃程度），藉由统计不同储存区域的存取频率，辨别出存取频率高的“热点”与存取频率低的“冷点”所在。然后便可依照追踪与统计结果，按一定周期自动执行数据迁移工作，将存取频率高的数据迁移到由SSD组成的磁盘区，存取频率低的则迁移到传统硬盘组成的磁盘区。
　　
　　而Flash快取的运作方式，则与一般的高速缓冲存储器大同小异，也就是把最近存取过的数据区块，存放到作为缓冲区的Flash记忆体中，接下来的后续存取操作中，系统会比对快取中的数据，若命中快取中的数据，就直接从高速的记忆体中存取数据，而无须到硬盘上存取。